Khoo Kongsi adalah persatuan puak Leong San Tong (Dewan Gunung Naga), yang nenek moyangnya berasal dari Kampuang XinAn, Daerah Haicang, Perbandaran Xiamen di wilayah Fujian. Orang Khoo adalah antara pedagang Baba Nyonya kaya di Melaka abad ke-17 dan Pulau Pinang di zaman awal. Pada abad ke-19, kompleks puak ini menyerupai sebuah kampung miniatur, dengan pemerintahan sendiri serta pertubuhan pendidikan, kewangan, kebajikan dan sosial. Kuil puak ini dibangun pada 1906 ketika puak Khoo berada di puncak kekayaan dan keunggulan dalam masyarakat Pulau Pinang.

Nenek moyang keluarga Khoo yang berhijrah dari China Selatan menjadikannya rumah kediaman bagi ahli keluarga Khoo pada 1851. Ia terbakar pada 1901, disyaki oleh panahan petir, dan masyarakat Cina percaya bahawa ia disebabkan oleh kemiripannya dengan Istana Maharaja yang memprovokasi para dewa. Versi yang diperkecil kemudiannya dibina pada 1902 dan siap pada 1906. Walaupun begitu, kompleks ini mempunyai dewan megah yang dihiasi dengan ukiran yang rumit dan balok kayu yang dihiasi dengan kaya dari tanda-tanda tukang mahir dari China. Kuil puak didedikasikan untuk dewa pelindung puak dan juga menempatkan koleksi tablet nenek moyang. Opera Cina masih dipentaskan di teater pada bulan lunar ketujuh.

Seperti banyak persatuan puak di Asia Tenggara, Khoo Kongsi bukan lagi pusat aktiviti sosial dan fungsi penting yang pernah diadakan. Strategi dan idea yang berbeza sedang dilaksanakan untuk mentakrifkan semula tempat persatuan puak pada abad ke-21. Kerana lokasinya di kawasan Warisan Dunia UNESCO di George Town, ia menjadi tarikan popular bagi pelancong yang berminat dengan budaya tempatan.

Pada 2017, Kuil Khoo Kongsi dibaik pulih dengan kos pemulihan bernilai RM2 juta.[1]